La historia transcurre en un mundo paralelo de las anteriores Fate/Zero y Fate/StayNight en el cual el grial fue arrebatado de la ciudad de Fuyuki en la etapa final del tercera Guerra por el Santo Grial en plena 2º guerra mundial, debido a este hecho tanto la cuarta como la quinta guerra jamás sucedieron.

Meses antes del inicio de esta, la asociación mágica de Londres al enterarse del paradero del Grial decide recuperarlo. Es así como debido a ciertas circuntancias, el sistema para llevar a cabo la guerra por el Grial cambia, permitiendo que otros 7 Servants sean convocados bajo el mando de sus respectivos 7 Masters y que además, la guerra no será un “todos contra todos”.

Una guerra entre facciones mágicas, los Black Servants contra los Red Servants; un total de 14 parejas que libraran una lucha a muerte con el único objetivo de reclamar el grial para el bando vencedor y en el medio la invocación de una nueva clase de servant (Ruler) el cual es convocado únicamente por la voluntad del grial se encargara de la misión de ser el mediador entre los dos bandos en el inicio de esta inevitable nueva Guerra por el Santo Grial.

Héroes legendarios de épocas pasadas como Espartaco, Aquiles, Vlad el Empalador, Jack el destripador, Frankenstein, y más serán revividos para enfrentarse en esta épica guerra a muerte en los roles de Saber, Archer, Rider, Lance, Assasin, Caster y Berserker.

El destino de esta nueva guerra, una guerra completamente diferente a los visto en Fate/StayNight y Fate/Zero está a punto de comenzar.

¿Y tú de qué lado estas?